На территории Национального парка произрастает более 1000 видов высших растений, определены 223 вида мохообразных, 131 вид лишайников.
В парке проходит северная граница распространения клена, липы, вяза, встречаются лещина и дикая яблоня.
10 видов растений занесены в Красную книгу РФ, 88 видов – в Красную книгу Вологодской области.
На территории парка найдены 24 вида семейства орхидных, некоторые из них образуют уникальные жизнеспособные популяции.
Подробнее в разделе О ПАРКЕ / ФЛОРА И ФАУНА