• Заповедная
• Особо охраняемая
• Рекреационная
• Зона хозяйственного назначения
• Зона охраны объектов культурного наследия (памятников истории и культуры) народов Российской Федерации

Функциональное зонирование национальных парков устанавливается уполномоченным федеральным органом исполнительной власти.

На всей территории национального парка запрещается любая деятельность, которая может нанести ущерб растительному и животному миру, культурно-историческим объектам и которая противоречит целям и задачам национального парка.     

В заповедной зоне запрещаются все виды хозяйственной и рекреационной деятельности, допускается проведение научных исследований, включая экологический мониторинг (без вмешательства в естественные процессы). На территории  заповедной зоны могут находиться государственные инспекторы в области охраны окружающей среды национального парка при исполнении служебных обязанностей и научные сотрудники, выполняющие работы по темам, утвержденным планом НИР национального парка.

Особо охраняемая зона предназначена для сохранения природной среды в естественном состоянии, допускается проведение экскурсий и посещение в целях познавательного туризма в сопровождении сотрудников национального парка. В особо охраняемой зоне запрещаются все виды деятельности, которые могут нанести ущерб природным комплексам и объектам растительного и животного мира и противоречат целям и задачам парка, в том числе: спортивная и любительская охота, спортивное и любительское рыболовство.

Посещение заповедной и особо охраняемой зон допускается по специальному разрешению, выдаваемому ФГБУ «Национальный парк «Русский Север» или Министерством природных ресурсов Российской Федерации.

Рекреационная зона предназначена для обеспечения и осуществления рекреационной деятельности, спортивной и любительской охоты, спортивного и любительского рыболовства, развития  физической культуры и спорта, а также размещения объектов туристической индустрии, музеев и информационных центров. В пределах этой зоны запрещается отдых и ночлег за пределами предусмотренных для этого мест.

Зона охраны объектов культурного наследия (памятников истории и культуры) народов Российской Федерации предназначена для сохранения этих объектов, также допускается рекреационная деятельность, проведение работ по восстановлению и поддержанию в традиционном состоянии приоритетных культурно-ландшафтных комплексов. Запрещается отдых и ночлег за пределами предусмотренных для этого мест.  

Зона хозяйственного назначения предназначена для осуществления деятельности, направленной на обеспечение функционирования национального парка и жизнедеятельности граждан, проживающих на его территории.